Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah1bQ06985 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms