Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms