Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn2Q06180 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms