Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cab39Q06138 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms