Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms