Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms