Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VcpQ01853 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms