Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms