Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde1bQ01065 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pde1bQ01065 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms