Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SeleQ00690 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SeleQ00690 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SeleQ00690 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms