Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax8Q00288 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms