Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd3P97770 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd3P97770 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms