Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec1P97353 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec1P97353 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms