Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms