Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NficP70255 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NficP70255 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NficP70255 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms