Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabrb3P63080 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms