Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps3P62908 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms