Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga11P61622 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms