Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csrnp3P59055 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp3P59055 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms