Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubgcp3P58854 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms