Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lim2P56563 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms