Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Faf1P54731 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms