Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CnbpP53996 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CnbpP53996 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms