Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cux1P53564 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cux1P53564 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms