Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Map3k1P53349 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Map3k1P53349 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms