Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dbx1P52950 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dbx1P52950 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms