Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FmodP50608 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FmodP50608 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FmodP50608 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FmodP50608 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms