Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp9P49962 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp9P49962 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp9P49962 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp9P49962 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms