Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmod1P49813 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms