Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CitP49025 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CitP49025 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CitP49025 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CitP49025 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms