Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LmnaP48678 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LmnaP48678 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms