Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax9P47242 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms