Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf4P43488 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms