Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf5P43027 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms