Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TfamP40630 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TfamP40630 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TfamP40630 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TfamP40630 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms