Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VhlP40338 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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