Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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