Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprkP35822 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprkP35822 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms