Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2aP35436 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2aP35436 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms