Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd22P35329 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd22P35329 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd22P35329 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms