Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nedd1P33215 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nedd1P33215 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms