Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vcam1P29533 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms