Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BgnP28653 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BgnP28653 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BgnP28653 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BgnP28653 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BgnP28653 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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