Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChgaP26339 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms