Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd1P25322 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms