Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms