Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd247P24161 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd247P24161 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms