Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PparaP23204 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PparaP23204 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PparaP23204 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PparaP23204 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PparaP23204 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms