Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F3P20352 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F3P20352 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
F3P20352 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F3P20352 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F3P20352 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms