Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VimP20152 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VimP20152 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VimP20152 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VimP20152 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VimP20152 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VimP20152 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VimP20152 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VimP20152 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms